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科技前沿清华一周内自然科学等再

日前,清华大学相关课题组在国际顶尖学术期刊《自然》《科学》等发表一系列重要研究成果。医学院颜宁研究组等在《科学》在线发表研究长文,揭示了目前已知分子量最大的离子通道Ryanodine受体RyR2亚型处于开放和关闭两种状态的三维电镜结构,探讨了RyR2的门控机制,并提出中心结构域极可能是控制心肌钙离子通道RyR开放的关键;生命学院杨茂君研究组在《自然》发表研究长文,首次报道了迄今为止分辨率最高的线粒体呼吸链超级复合物——呼吸体的冷冻电镜三维结构;生命学院颉伟和医学院那洁研究组在《自然》发文,颉伟研究组在《分子细胞》发表研究论文,两篇论文在世界上首次报道了哺乳动物组蛋白修饰是如何从亲代传递到子代的,以及早期胚胎发育中组蛋白修饰遗传和重编程的模式和分子机制。

颜宁等发文揭示RyR2长程门控机制的结构基础

中心结构域极可能是控制心肌钙离子通道RyR2开放的关键

RyR是广泛存在于肌肉细胞(包括骨骼肌和心肌)及脑组织中的钙离子释放通道,其功能是在收到上游信号后,将内质网或肌质网中的钙离子迅速释放到细胞质中,从而触发进一步的信号传递,比如导致肌肉收缩等等。在哺乳动物中,RyR有三个亚型,其中RyR1和RyR2已分别被证实在骨骼肌和心肌的兴奋-收缩偶联(excitation-contractioncoupling,ECC)中发挥作用。所谓兴奋-收缩偶联,就是神经信号控制肌肉收缩的过程,即上游的电压门控钙离子通道Cav在收到动作电位刺激活化后激活RyR,从而最终导致肌肉收缩这一生理过程。肌肉收缩的生理重要性不言而喻,从分子乃至原子水平理解兴奋-收缩偶联具有重要意义。

北京时间年9月22日,清华大学医学院颜宁研究组与加拿大卡尔加里大学(UniversityofCalgary)陈穗荣研究组合作在《科学》(Science)期刊在线发表标题为“2型Ryanodine受体RyR2门控机制的结构基础”(Structuralbasisforthegatingmechanismofthetype2ryanodinereceptorRyR2)的研究长文,揭示了目前已知分子量最大的离子通道Ryanodine受体RyR2亚型处于开放和关闭两种状态的三维电镜结构,探讨了RyR2的门控机制,并提出中心结构域极可能是控制心肌钙离子通道RyR开放的关键。

RyR1和RyR2分别主要在骨骼肌和心肌中发挥作用,尽管其为同源蛋白、结构序列相近,但被上游Cav通道激活的方式却存在很大差异。研究表明,Cav1.1能够与RyR1形成超级复合物,并通过构象变化激活RyR1;而RyR2的激活则主要依靠经Cav1.2涌入的钙离子来实现。此外,RyR2的突变会导致心脏功能紊乱,引发如儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速、特发性心室颤动、心脏性猝死等疾病。

最新发表在《科学》期刊上的论文中,颜宁研究组针对心脏中兴奋-收缩偶联过程开展的研究工作获得了RyR2处于关闭和开放两种不同状态的近原子分辨率冷冻电镜结构。RyR2蛋白样品纯化自猪心,样品的获取非常不易。在清华大学冷冻电镜平台及相关技术快速发展的支持下,研究组最终仅利用少量蛋白样品,使用EDTA来锁定RyR2的关闭构象,利用20μM的钙离子和小分子PCB95来稳定住开放构象,最终获得了分辨率分别为4.2埃的关闭构象和4.1埃的开放构象的两个结构。

关闭及开放构象的RyR2。

通过比较关闭和开放状态的两个结构(如图所示),研究组发现位于穿膜区域负责通透离子的通道有明显的变化:在开放构象中,该通道发生扩张,从而使得钙离子能够顺利地从肌质网内部转移到细胞质中。RyR2细胞质一侧的可溶区域占据整个蛋白很大的比例,在开放状态下,这部分区域向着肌质网膜靠近,同时还伴随着一定程度的旋转。通过对RyR2中每个相对独立的结构域的仔细比较和分析,研究组认为中心结构域(Centraldomain)极有可能是介导胞质内信号长程传递引发RyR开放的关键,这一发现与之前有关RyR的功能研究结论相吻合。另外,这篇文章还对部分观察到的结构信息进行了功能方面的验证研究,从而更加全面地展示了RyR2的结构及功能特性。

值得一提的是,这项研究成果是颜宁研究组在离子通道,特别是兴奋-收缩偶联领域取得的又一重要进展。在此之前,颜宁研究组发表了一系列工作,包括第一个RyR1的高分辨率原子结构以及第一个Cav1.1复合物的高分辨率冷冻电镜结构。研究组的后续研究进一步表明,即使在通道保持关闭时,RyR1的胞质区也依然会呈现出不同的动态变化。另外,研究组还获得了分辨率为5.7埃的RyR1开放构象结构,并基于结构比对,初步分析了RyR1的门控机理。有关RyR1的这些成果已作为两篇研究论文分别发表在《自然》(Nature)和《细胞研究》(CellResearch)上,有关Cav1.1的两篇论文分别发表于《科学》(Science)和《自然》杂志。上述研究与最新的这篇《科学》期刊发表的论文极大地促进了人们对于兴奋-收缩偶联的理解。

这篇研究论文的通讯作者是清华大学医学院的颜宁教授和卡尔加里大学的陈穗荣(S.R.WayneChen)教授,共同第一作者为清华大学生命学院级PTN项目彭伟博士、级PTN项目博士生申怀宗、以及级CLS项目博士生吴建平。国家蛋白质科学研究(北京)设施清华大学冷冻电镜平台为数据收集提供了支持,清华大学高性能计算平台为数据处理提供了支持。相关研究得到了科技部、国家自然科学基金委、以及加拿大相关研究机构的经费支持。颜宁教授是清华大学医学院教授、拜耳讲席医院国际青年科学家。

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